Cell line FreeStyle 293-F

Taxonomy

• Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)

Protein

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)    P0DTC2

Source

• FreeStyle 293-F (CVCL_D603)  

Reported structure

Composition

• Hex:3 HexNAc:2 (avg mass : 910.8325 )
• Hex:3 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1056.9755 )
• Hex:3 HexNAc:3 (avg mass : 1114.0275 )
• Hex:3 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1260.1705 )
• Hex:3 HexNAc:4 (avg mass : 1317.2225 )
• Hex:3 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1608.4804 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1463.3655 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1609.5085 )
• Hex:3 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 1755.6515 )
• Hex:3 HexNAc:5 (avg mass : 1520.4175 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1666.5605 )
• Hex:3 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1957.8184 )
• Hex:3 HexNAc:6 (avg mass : 1723.6125 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 1869.7555 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2161.0134 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2015.8985 )
• Hex:3 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2162.0415 )
• Hex:3 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2072.9505 )
• Hex:4 HexNAc:2 (avg mass : 1072.9749 )
• Hex:4 HexNAc:2 dHex:1 (avg mass : 1219.1179 )
• Hex:4 HexNAc:3 (avg mass : 1276.1699 )
• Hex:4 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1567.4278 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1422.3129 )
• Hex:4 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1713.5708 )
• Hex:4 HexNAc:4 (avg mass : 1479.3649 )
• Hex:4 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1770.6228 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1625.5079 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 1916.7658 )
• Hex:4 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1771.6509 )
• Hex:4 HexNAc:5 (avg mass : 1682.5599 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 1973.8178 )
• Hex:4 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2265.0757 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1828.7029 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2119.9608 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2411.2187 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 1974.8459 )
• Hex:4 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2266.1038 )
• Hex:4 HexNAc:6 (avg mass : 1885.7549 )
• Hex:4 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2177.0128 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2031.8979 )
• Hex:4 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2178.0409 )
• Hex:4 HexNAc:7 (avg mass : 2088.9499 )
• Hex:4 HexNAc:7 dHex:1 (avg mass : 2235.0929 )
• Hex:5 HexNAc:2 (avg mass : 1235.1173 )
• Hex:5 HexNAc:3 (avg mass : 1438.3123 )
• Hex:5 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1729.5702 )
• Hex:5 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1584.4553 )
• Hex:5 HexNAc:4 (avg mass : 1641.5073 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 1932.7652 )
• Hex:5 HexNAc:4 NeuAc:2 (avg mass : 2224.0231 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1787.6503 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2078.9082 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2370.1661 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 1933.7933 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2225.0512 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2079.9363 )
• Hex:5 HexNAc:4 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2371.1942 )
• Hex:5 HexNAc:5 (avg mass : 1844.7023 )
• Hex:5 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2135.9602 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 1990.8453 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2282.1032 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2573.3611 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2136.9883 )
• Hex:5 HexNAc:5 dHex:3 (avg mass : 2283.1313 )
• Hex:5 HexNAc:6 (avg mass : 2047.8973 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2194.0403 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2485.2982 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2776.5561 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3067.814 )
• Hex:5 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2340.1833 )
• Hex:6 HexNAc:2 (avg mass : 1397.2597 )
• Hex:6 HexNAc:3 (avg mass : 1600.4547 )
• Hex:6 HexNAc:3 NeuAc:1 (avg mass : 1891.7126 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 (avg mass : 1746.5977 )
• Hex:6 HexNAc:3 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2037.8556 )
• Hex:6 HexNAc:4 (avg mass : 1803.6497 )
• Hex:6 HexNAc:4 NeuAc:1 (avg mass : 2094.9076 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 (avg mass : 1949.7927 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2241.0506 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:2 (avg mass : 2095.9357 )
• Hex:6 HexNAc:4 dHex:3 (avg mass : 2242.0787 )
• Hex:6 HexNAc:5 (avg mass : 2006.8447 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:1 (avg mass : 2298.1026 )
• Hex:6 HexNAc:5 NeuAc:2 (avg mass : 2589.3605 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 (avg mass : 2152.9877 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2444.2456 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2735.5035 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3026.7614 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 (avg mass : 2299.1307 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:2 NeuAc:1 (avg mass : 2590.3886 )
• Hex:6 HexNAc:5 dHex:3 NeuAc:1 (avg mass : 2736.5316 )
• Hex:6 HexNAc:6 (avg mass : 2210.0397 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2356.1827 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2647.4406 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 2938.6985 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:2 (avg mass : 2502.3257 )
• Hex:6 HexNAc:6 dHex:3 (avg mass : 2648.4687 )
• Hex:7 HexNAc:2 (avg mass : 1559.4021 )
• Hex:7 HexNAc:6 (avg mass : 2372.1821 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:1 (avg mass : 2663.44 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:2 (avg mass : 2954.6979 )
• Hex:7 HexNAc:6 NeuAc:4 (avg mass : 3537.2137 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 (avg mass : 2518.3251 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:1 (avg mass : 2809.583 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:2 (avg mass : 3100.8409 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:1 NeuAc:3 (avg mass : 3392.0988 )
• Hex:7 HexNAc:6 dHex:4 NeuAc:1 (avg mass : 3248.012 )
• Hex:8 HexNAc:2 (avg mass : 1721.5445 )
• Hex:9 HexNAc:2 (avg mass : 1883.6869 )

Disease

• COVID-19 (DOID:0080600)

Reference

• Site-specific glycan analysis of the SARS-CoV-2 spike (2020 - Yasunori Watanabe, Joel D. Allen, Daniel Wrapp, Jason S. McLellan, Max Crispin) / Status : Unreviewed

Reported glycosite

• Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
  •        Asn-17
  •        Asn-61
  •        Asn-74
  •        Asn-122
  •        Asn-149
  •        Asn-165
  •        Asn-234
  •        Asn-282
  •        Asn-331
  •        Asn-343
  •        Asn-602
  •        Asn-615
  •        Asn-657
  •        Asn-709
  •        Asn-717
  •        Asn-801
  •        Asn-1074
  •        Asn-1098
  •        Asn-1134
  •        Asn-1159
  •        Asn-1174
  •        Asn-1194

Mass spectrometry observed peptide

• QCVNLTTR (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-17     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• FSNVTWF (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-61     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• HAIHVSGTNGTKRF (14aa)
  •    P0DTC2    Asn-74     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• FHAIHVSGTNGTKRF (15aa)
  •    P0DTC2    Asn-74     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• TQSLLIVNNATNVVIK (16aa)
  •    P0DTC2    Asn-122     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• IVNNATNVVIKVCEF (15aa)
  •    P0DTC2    Asn-122     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• YHKNNKSWMESEF (13aa)
  •    P0DTC2    Asn-149     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• SSANNCTF (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-165     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• SSANNCTFEY (10aa)
  •    P0DTC2    Asn-165     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• SSANNCTFEYVSQPF (15aa)
  •    P0DTC2    Asn-165     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• GINIT (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-234     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KYNENGTIT (9aa)
  •    P0DTC2    Asn-282     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• FLLKYNENGTIT (12aa)
  •    P0DTC2    Asn-282     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• RFPNIT (6aa)
  •    P0DTC2    Asn-331     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• GEVFNATRF (9aa)
  •    P0DTC2    Asn-343     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• NATRF (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-343     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• GGVSVITPGTNTSNQVAVLY (20aa)
  •    P0DTC2    Asn-602     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• VITPGTNTS (9aa)
  •    P0DTC2    Asn-602     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• LYQDVNCT (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-615     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• NNSYECDIPI (10aa)
  •    P0DTC2    Asn-657     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• YSNNSIAIPT (10aa)
  •    P0DTC2    Asn-709     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• YSNNSIA (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-709     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• SNNSIAIPT (9aa)
  •    P0DTC2    Asn-709     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• NFTIS (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-717     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• DFGGFNFSQILPDPSKPSK (19aa)
  •    P0DTC2    Asn-801     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• FGGFNFS (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-801     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• VPAQEKNF (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-1074     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• NGTHWFV (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-1098     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• NGTHWFVT (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-1098     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• IGIVNNT (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-1134     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• IVNNT (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-1134     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KNH (3aa)
  •    P0DTC2    Asn-1159     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KYFKNHTS (8aa)
  •    P0DTC2    Asn-1159     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• GINASVV (7aa)
  •    P0DTC2    Asn-1174     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• GINAS (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-1174     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KNLNE (5aa)
  •    P0DTC2    Asn-1194     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KNLNES (6aa)
  •    P0DTC2    Asn-1194     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• KNLN (4aa)
  •    P0DTC2    Asn-1194     Recombinant Spike glycoprotein (FreeStyle 293-F) / Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)